Ο σχεδιασμός εφοδιασμού για εμβολιασμό πληθυσμού νησιών της Χώρας έγινε από το ΓΕΕΘΑ σε συντονισμό με το Υπ. Υγείας και σε συνεργασία με την Γ.Γ.Π.Π. Το πλάνο εμβολιασμού περιλαμβάνει 4 Φάσεις:
18 Νησιά με Νοσοκομειακές Μονάδες
12 Νησιά με Πληθυσμό άνω των 3.500
19 Νησιά με Πληθυσμό από 1.000 έως 3.500
Νησιά με Πληθυσμό κάτω από 1.000
18 Νησιά με Νοσοκομειακές Μονάδες
Έναρξη εμβολιασμού Υγειονομικού Προσωπικού: 11 Ιανουαρίου
Συνεχίζεται για μόνιμους κατοίκους σύμφωνα με τις οδηγίες της Εθνικής Επιτροπής Εμβολιασμού
| Ρόδος | Σύρος |
| Κέρκυρα | Νάξος |
| Λέσβος | Θήρα |
| Χίος | Λήμνος |
| Κως | Κάλυμνος |
| Ζάκυνθος | Κύθηρα |
| Κεφαλλονιά | Ικαρία |
| Σάμος | Λέρος |
| Λευκάδα | Κάρπαθος |
12 Νησιά με Πληθυσμό άνω των 3.500
Έναρξη εμβολιασμού για μόνιμους κάτοικους άνω των 80 ετών: 28 Ιανουαρίου 2021
Θα συνεχιστεί για τις επόμενες ηλικιακές ομάδες σύμφωνα με τις οδηγίες της Εθνικής Επιτροπής Εμβολιασμού
| Σαλαμίνα | Σκόπελος |
| Θάσος | Μήλος |
| Πάρος | Μύκονος |
| Αίγινα | Πόρος |
| Άνδρος | Σπέτσες |
| Τήνος | Σκιάθος |
19 Νησιά με Πληθυσμό από 1.000 έως 3.500
Έναρξη εμβολιασμού για μόνιμους κάτοικους: 10 Φεβρουαρίου 2021
| Πάτμος | Ύδρα |
| Ιθάκη | Αμοργός |
| Σύμη | Κύθνος |
| Σκύρος | Σέριφος |
| Σαμοθράκη | Αστυπάλαια |
| Αλόννησος | Φούρνοι |
| Σίφνος | Αντίπαρος |
| Κέα | Αγκίστρι |
| Παξοί | Κάσος |
Νησιά με Πληθυσμό κάτω από 1.000
Εμβολιασμός σε συνεργασία με Υπ. Εσωτερικών και Φορείς Τοπικής Αυτοδιοίκησης για επιθυμούντες κατοίκους άνω των 18 ετών. Εκτιμώμενη ολοκλήρωση τον Φεβρουάριο 2021
Έναρξη φάσης με το Καστελόριζο: 27-30 Ιανουαρίου 2021
| Μεγανήσι | Κάλαμος | Αγαθονήσι |
| Νίσυρος | Ερεικούσσα | Δονούσα |
| Ελαφόνησος | Σαρία | Γαύδος |
| Κίμωλος | Άνω Κουφονήσι | Ηρακλειά |
| Τήλος | Ψαρά | Θύμαινα |
| Οινούσσες | Μαθράκι | Τέλενδος |
| Φολέγανδρος | Θηρασιά | Τριζόνια |
| Λειψοί | Ανάφη | Καστός |
| Χάλκη | Σίκινος | Ψέριμος |
| Αμμουλιανή | Άγιος Ευστράτιος | Π. Τρίκερι |
| Οθωνοί | Σχοινούσα | Γυαλί |
| Αντικύθηρα | Περιστέρα | Αντίπαξοι |
| Αρκοί | Μαράθι | Δοκός |
| Καστελόριζο | Καλόλιμνος | Φαρμακονήσι |
Μεταφορά εμβολίων και προσωπικού:
- Αεροπορικώς με μέσα του ΓΕΕΘΑ και της ΓΓΠΠ
- Ακτοπλοϊκώς με τακτικά δρομολόγια
- Ακτοπλοϊκώς με σκάφη του ΛΣ
